超聲波濾芯清洗機的清洗過程分為：浸泡、粗洗、精洗。

1.浸泡

    首先把超聲波濾芯清洗機放置好，把清洗機的外端有兩個接口分別接離子水和凈化空氣，打開閥門注滿離子水到溢流的位置關閉閥門，將清洗液配制成濃度為2％的氫氧化鈉或者是20％的檸檬酸即可，然后把使用過的濾芯放在配好濃度的超聲波清洗槽里，浸泡20~30分鐘（根據濾芯的數量來定時間）

2.粗洗

（1）浸泡時間到了以后不用放掉水打開超聲波開關進行粗洗，粗洗時間約為5~10分鐘即可。

（2） 洗完*次以后關掉超聲波開關打開排水閥門將污染水放掉，然后重新注滿無毛點的離子水到溢流的位置再清洗3~5分鐘即可，粗洗完畢以后基本為凈化濾芯，如果要求嚴格的話在進行一次粗洗。

3.精洗

    粗洗完畢后把所有的濾芯都拿出來，安裝好預先備好的工裝（10英寸，20英寸不同的型號用不同的工裝）把濾芯逐個放在清洗槽中間打開超聲波開關、電機轉動開關，在打開清洗槽外端的進水閥門進行內外反沖，如有凈化空氣的就打開進氣閥門（作為濾芯加速清洗和吹干的作用）。精洗時間約1~3分鐘即可。